Rasterikuvakorrelaatiospektroskopiamittauksia Nikon A1R+ -konfokaalimikroskoopilla

Rasterikuvakorrelaatiospektroskopia (RICS) on kvantitatiivinen mikroskopiamenetelmä molekyylidynamiikan tutkimiseen kaksiulotteisista konfokaalikuvista. Tutkielmassa käydään läpi menetelmän teoreettiset ja kokeelliset lähtökohdat, ja niiden pohjalta määritetään kaupallisen konfokaalimikroskooppijärj...

Täydet tiedot

Bibliografiset tiedot
Päätekijä: Ruhanen, Tuukka
Muut tekijät: Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta, Faculty of Sciences, Fysiikan laitos, Department of Physics, University of Jyväskylä, Jyväskylän yliopisto
Aineistotyyppi: Pro gradu
Kieli:fin
Julkaistu: 2014
Aiheet:
Linkit: https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/45337
Kuvaus
Yhteenveto:Rasterikuvakorrelaatiospektroskopia (RICS) on kvantitatiivinen mikroskopiamenetelmä molekyylidynamiikan tutkimiseen kaksiulotteisista konfokaalikuvista. Tutkielmassa käydään läpi menetelmän teoreettiset ja kokeelliset lähtökohdat, ja niiden pohjalta määritetään kaupallisen konfokaalimikroskooppijärjestelmän (Nikon A1R+, Jyväskylän yliopiston Nanotiedekeskus) soveltuvuus diffuusion mittaamiseen RICS-menetelmällä. Järjestelmän havaittiin soveltuvan heikosti erityisesti nopeiden molekyylien, kuten EGFP-proteiinin mittaamiseen. Suurin haitta oli ilmaisimen häiriösignaali, jonka seurauksena korrelaatioanalyysin tulokset poikkesivat merkittävästi kirjallisuusarvoista. Työssä tehtiin lisäksi yleisiä huomioita RICS-menetelmän yksityiskohdista. Esimerkiksi mikroskoopin skannausnopeuden muuttumisella todettiin olevan yllättävän suuri merkitys ottaen huomioon sen, ettei sitä tiettävästi ole käsitelty aiemmissa julkaisuissa. Raster image correlation spectroscopy (RICS) is a microscopy technique for quantitatively studying the dynamics of fluorescent species from 2D confocal images. In this thesis the theoretical and practical principles of RICS are discussed and demonstrated. On the basis of the theory, the applicability of a commercial confocal microscope system (Nikon A1R+, Nanoscience Center, University of Jyväskylä) for RICS diffusion measurements is determined. The system was found to be inefficient especially for measuring fast molecules, such as EGFP. The greatest drawback was high detector correlation, because of which results determined from fast fluctuations deviated significantly from literature values. Measurements were performed also to study the RICS method on a more general level. For example variable scan speed was found to be surprisingly important considering the fact that apparently it has not been discussed in previous publications.