Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla

Kasvin solukossa symbioosissa elävät endofyyttisienet tuottavat suuren määrän bioaktiivisia aineita, joiden avulla ne muun muassa osallistuvat kasvin immuunipuolustukseen ja tuholaisten torjuntaan. Maapallon kaikista sienilajeista tunnetaan vain murto-osa ja niiden tuottamissa metaboliatuotteissa on...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Westerholm, Anni
Other Authors: Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta, Faculty of Sciences, Bio- ja ympäristötieteiden laitos, Department of Biological and Environmental Science, Jyväskylän yliopisto, University of Jyväskylä
Format: Master's thesis
Language:fin
Published: 2024
Subjects:
Online Access: https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/96130
_version_ 1826225728194084864
author Westerholm, Anni
author2 Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Bio- ja ympäristötieteiden laitos Department of Biological and Environmental Science Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä
author_facet Westerholm, Anni Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Bio- ja ympäristötieteiden laitos Department of Biological and Environmental Science Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä Westerholm, Anni Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Bio- ja ympäristötieteiden laitos Department of Biological and Environmental Science Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä
author_sort Westerholm, Anni
datasource_str_mv jyx
description Kasvin solukossa symbioosissa elävät endofyyttisienet tuottavat suuren määrän bioaktiivisia aineita, joiden avulla ne muun muassa osallistuvat kasvin immuunipuolustukseen ja tuholaisten torjuntaan. Maapallon kaikista sienilajeista tunnetaan vain murto-osa ja niiden tuottamissa metaboliatuotteissa on suuri potentiaali antiviraalisten yhdisteiden löytämiseksi. Tutkielmassa etsittiin kuudesta eri endofyyttisieninäytteestä antiviraalista vaikutusta HCov-OC43-koronavirukselle ja CVA9-enterovirukselle. Molemmat virukset ovat yksijuosteisia RNA-viruksia ja niitä vastaan on kehitetty vain muutamia rokotteita. Käytetyistä näytteistä ei löydetty antiviraalista vaikutusta koronavirukselle, mutta enterovirukselle yhdellä sieninäytteellä (E12117 MY) nähtiin antiviraalista vaikutusta erityisesti suuremmilla pitoisuuksilla. Tämän näytteen vaikutusta CVA9-viruksen kapsidirakenteeseen ja kulkeutumista soluissa tutkittiin lisää. Sulamispistettä tutkimalla havaittiin virusta stabiloiva vaikutus, joka nähtiin käsittelyn jälkeen sulamispisteen nousuna. Stabilisaatiota tuki myös koe, missä viruskapsidin reaaliaikaista avautumista tutkittiin. Koe perustui SYBR Green II -värin sitoutumiseen viruksesta vapautuvaan RNA:han. Tämän lisäksi radioaktiivisesti leimatun viruksen signaalia seuraamalla oletettiin endofyyttisieninäytteen vaikuttavan viruksen rakenteeseen aggregoivasti. Tätä oletusta tuki myös läpivalaisuelektronimikroskoopilla otetut kuvat viruksesta. E12117 MY -näytteen vaikutusta CVA9-viruksen kulkeutumiseen soluissa tutkittiin konfokaalimikroskoopilla ja havaittiin, että näytteellä ei ollut siihen vaikutusta. Yhdessä nämä tulokset osoittavat, että endofyyttisienestä E12117 MY löytyy potentiaalista antiviraalista vaikutusta CVA9-virusta vastaan ja tämä vaikutus perustuu viruksen lisääntyneeseen stabiilisuuteen. Sieninäytteen fraktiointi ja vaikuttavan yhdisteen tai yhdisteiden identifiointi voisi olla seuraava tutkimusvaihe sieninäytteen antiviraalisuutta tutkittaessa.
first_indexed 2024-06-24T20:00:42Z
format Pro gradu
free_online_boolean 1
fullrecord [{"key": "dc.contributor.advisor", "value": "Marjom\u00e4ki, Varpu", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "advisor", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.advisor", "value": "Laajala, Mira", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "advisor", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.author", "value": "Westerholm, Anni", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "author", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.accessioned", "value": "2024-06-24T11:40:58Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "accessioned", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.available", "value": "2024-06-24T11:40:58Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "available", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.issued", "value": "2024", "language": "", "element": "date", "qualifier": "issued", "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.uri", "value": "https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/96130", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "uri", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.abstract", "value": "Kasvin solukossa symbioosissa el\u00e4v\u00e4t endofyyttisienet tuottavat suuren m\u00e4\u00e4r\u00e4n bioaktiivisia aineita, joiden avulla ne muun muassa osallistuvat kasvin immuunipuolustukseen ja tuholaisten torjuntaan. Maapallon kaikista sienilajeista tunnetaan vain murto-osa ja niiden tuottamissa metaboliatuotteissa on suuri potentiaali antiviraalisten yhdisteiden l\u00f6yt\u00e4miseksi. Tutkielmassa etsittiin kuudesta eri endofyyttisienin\u00e4ytteest\u00e4 antiviraalista vaikutusta HCov-OC43-koronavirukselle ja CVA9-enterovirukselle. Molemmat virukset ovat yksijuosteisia RNA-viruksia ja niit\u00e4 vastaan on kehitetty vain muutamia rokotteita. K\u00e4ytetyist\u00e4 n\u00e4ytteist\u00e4 ei l\u00f6ydetty antiviraalista vaikutusta koronavirukselle, mutta enterovirukselle yhdell\u00e4 sienin\u00e4ytteell\u00e4 (E12117 MY) n\u00e4htiin antiviraalista vaikutusta erityisesti suuremmilla pitoisuuksilla. T\u00e4m\u00e4n n\u00e4ytteen vaikutusta CVA9-viruksen kapsidirakenteeseen ja kulkeutumista soluissa tutkittiin lis\u00e4\u00e4. Sulamispistett\u00e4 tutkimalla havaittiin virusta stabiloiva vaikutus, joka n\u00e4htiin k\u00e4sittelyn j\u00e4lkeen sulamispisteen nousuna. Stabilisaatiota tuki my\u00f6s koe, miss\u00e4 viruskapsidin reaaliaikaista avautumista tutkittiin. Koe perustui SYBR Green II -v\u00e4rin sitoutumiseen viruksesta vapautuvaan RNA:han. T\u00e4m\u00e4n lis\u00e4ksi radioaktiivisesti leimatun viruksen signaalia seuraamalla oletettiin endofyyttisienin\u00e4ytteen vaikuttavan viruksen rakenteeseen aggregoivasti. T\u00e4t\u00e4 oletusta tuki my\u00f6s l\u00e4pivalaisuelektronimikroskoopilla otetut kuvat viruksesta. E12117 MY -n\u00e4ytteen vaikutusta CVA9-viruksen kulkeutumiseen soluissa tutkittiin konfokaalimikroskoopilla ja havaittiin, ett\u00e4 n\u00e4ytteell\u00e4 ei ollut siihen vaikutusta. Yhdess\u00e4 n\u00e4m\u00e4 tulokset osoittavat, ett\u00e4 endofyyttisienest\u00e4 E12117 MY l\u00f6ytyy potentiaalista antiviraalista vaikutusta CVA9-virusta vastaan ja t\u00e4m\u00e4 vaikutus perustuu viruksen lis\u00e4\u00e4ntyneeseen stabiilisuuteen. Sienin\u00e4ytteen fraktiointi ja vaikuttavan yhdisteen tai yhdisteiden identifiointi voisi olla seuraava tutkimusvaihe sienin\u00e4ytteen antiviraalisuutta tutkittaessa.", "language": "fi", "element": "description", "qualifier": "abstract", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Submitted by Miia Hakanen (mihakane@jyu.fi) on 2024-06-24T11:40:58Z\nNo. of bitstreams: 0", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Made available in DSpace on 2024-06-24T11:40:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0\n Previous issue date: 2024", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.extent", "value": "43", "language": "", "element": "format", "qualifier": "extent", "schema": "dc"}, {"key": "dc.language.iso", "value": "fin", "language": null, "element": "language", "qualifier": "iso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights", "value": "In Copyright", "language": "en", "element": "rights", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "antiviraaliset aineet", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "coxsackievirus", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.title", "value": "Endofyyttisienin\u00e4ytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla", "language": "", "element": "title", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.type", "value": "master thesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.urn", "value": "URN:NBN:fi:jyu-202406244976", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "urn", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Master\u2019s thesis", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Pro gradu -tutkielma", "language": "fi", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Faculty of Sciences", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Bio- ja ymp\u00e4rist\u00f6tieteiden laitos", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Department of Biological and Environmental Science", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "Jyv\u00e4skyl\u00e4n yliopisto", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "University of Jyv\u00e4skyl\u00e4", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Solu- ja molekyylibiologia", "language": "fi", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Cell and molecular biology", "language": "en", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "yvv.contractresearch.funding", "value": "0", "language": "", "element": "contractresearch", "qualifier": "funding", "schema": "yvv"}, {"key": "dc.type.coar", "value": "http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc", "language": null, "element": "type", "qualifier": "coar", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.accesslevel", "value": "openAccess", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "accesslevel", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.publication", "value": "masterThesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": "publication", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.oppiainekoodi", "value": "4013", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "oppiainekoodi", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "endofyytit", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "koronavirukset", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "virukset", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "sienet", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.url", "value": "https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "url", "schema": "dc"}]
id jyx.123456789_96130
language fin
last_indexed 2025-02-18T10:54:24Z
main_date 2024-01-01T00:00:00Z
main_date_str 2024
online_boolean 1
online_urls_str_mv {"url":"https:\/\/jyx.jyu.fi\/bitstreams\/6b44e033-1e68-4b02-9a5f-501ffbda0185\/download","text":"URN:NBN:fi:jyu-202406244976.pdf","source":"jyx","mediaType":"application\/pdf"}
publishDate 2024
record_format qdc
source_str_mv jyx
spellingShingle Westerholm, Anni Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla antiviraaliset aineet coxsackievirus Solu- ja molekyylibiologia Cell and molecular biology 4013 endofyytit koronavirukset virukset sienet
title Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla
title_full Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla
title_fullStr Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla
title_full_unstemmed Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla
title_short Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla
title_sort endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona ja enteroviruksilla
title_txtP Endofyyttisieninäytteiden antiviraalinen vaikutus korona- ja enteroviruksilla
topic antiviraaliset aineet coxsackievirus Solu- ja molekyylibiologia Cell and molecular biology 4013 endofyytit koronavirukset virukset sienet
topic_facet 4013 Cell and molecular biology Solu- ja molekyylibiologia antiviraaliset aineet coxsackievirus endofyytit koronavirukset sienet virukset
url https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/96130 http://www.urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202406244976
work_keys_str_mv AT westerholmanni endofyyttisieninäytteidenantiviraalinenvaikutuskoronajaenteroviruksilla