Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla

Antibioottivastustuskyvyn leviäminen bakteerikantojen välillä horisontaalisen geeninsiirron avulla on merkittävä ja kasvava maailmanlaajuinen ongelma ihmisten terveydelle. Siirtämällä konjugaation avulla laajakirjoisia β-laktamaasi (ESBL)–geenejä tuottavia plasmideja vastustuskykyiset bakteerikannat...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Tuononen, Timo
Other Authors: Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta, Faculty of Sciences, Bio- ja ympäristötieteiden laitos, Department of Biological and Environmental Science, Jyväskylän yliopisto, University of Jyväskylä
Format: Master's thesis
Language:fin
Published: 2019
Subjects:
Online Access: https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/66894
_version_ 1826225766983008256
author Tuononen, Timo
author2 Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Bio- ja ympäristötieteiden laitos Department of Biological and Environmental Science Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä
author_facet Tuononen, Timo Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Bio- ja ympäristötieteiden laitos Department of Biological and Environmental Science Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä Tuononen, Timo Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Bio- ja ympäristötieteiden laitos Department of Biological and Environmental Science Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä
author_sort Tuononen, Timo
datasource_str_mv jyx
description Antibioottivastustuskyvyn leviäminen bakteerikantojen välillä horisontaalisen geeninsiirron avulla on merkittävä ja kasvava maailmanlaajuinen ongelma ihmisten terveydelle. Siirtämällä konjugaation avulla laajakirjoisia β-laktamaasi (ESBL)–geenejä tuottavia plasmideja vastustuskykyiset bakteerikannat pystyvät pelastamaan antibiooteille alttiita bakteereja myös tappavassa antibioottialtistuksessa. Tämä tutkimus pyrkii selvittämään mikä on bakteerien ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus tähän pelastuskykyyn. Viittä eri ESBLplasmideja sisältävää JM109 E.coli-kantaa kasvatettiin yhdessä ampisilliinille alttiin HMS174 E.coli-kannan kanssa 5% ja 100% ravinnetasossa sekä ilman antibioottia, että tappavassa ampisilliinikonsentraatiossa. Ampisilliinivastustuskyvyn siirtymistä ESBL-plasmidien mukana tutkittiin kasvattamalla näytteitä kasvatuksista ampisilliiniä ja rifampisiiniä sisältävillä maljoilla joilla vain ESBLplasmidin sisältävät HMS174 transkonjugantit pystyvät kasvamaan. Tulokset osoittivat että eri plasmidien kyky siirtyä bakteerikantojen välillä vaihtelee merkittävästi. Ravinteiden määrä, antibioottivalinta ja plasmidien ominaisuudet, kuten niiden koko, vaikuttavat voimakkaasti konjugaatiotehokkuuteen. Tutkimuksen tulokset voivat auttaa ymmärtämään antibioottiresistenssin evoluutiota ESBL-bakteerien infektoimissa potilaissa. The spread of antibiotic resistance between bacterial strains by plasmid-mediated conjugative horizontal gene transfer is a significant and growing global threat to human welfare. Resistant bacterial strains can rescue susceptible bacteria by conjugative transfer of extended spectrum β-lactamase (ESBL)-genes containing plasmids in lethal antibiotic concentrations. This study aims to investigate how the nutritional level of the environment effects this rescue potential. Five different ESBL-plasmid containig JM109 E.coli-srains were grown together with an ampicillin susceptible HMS174 E.coli-strain in 5% and 100% nutritional levels with and without antibiotic selection. The transfer of ampicillin resistance was studied by growing samples on plates containig ampicillin and rifampicin, on which only the ESBL-plasmid containing HMS174 transconjugants could grow. The ability of these plasmids to transfer themselves conjugatively between bacterial strains varied significantly. The amount of nutrients, antibiotic selection and the properties of the plasmids, such as their size, have a stong effect on the efficiency of conjugational gene transfer. The results of the study may help to understand the evolution of resistance in patients infected by ESBL-bacteria.
first_indexed 2019-12-18T21:09:21Z
format Pro gradu
free_online_boolean 1
fullrecord [{"key": "dc.contributor.advisor", "value": "Mattila, Sari", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "advisor", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.advisor", "value": "Ojala, Ville", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "advisor", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.author", "value": "Tuononen, Timo", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "author", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.accessioned", "value": "2019-12-18T06:49:45Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "accessioned", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.available", "value": "2019-12-18T06:49:45Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "available", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.issued", "value": "2019", "language": "", "element": "date", "qualifier": "issued", "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.uri", "value": "https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/66894", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "uri", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.abstract", "value": "Antibioottivastustuskyvyn levi\u00e4minen bakteerikantojen v\u00e4lill\u00e4 horisontaalisen\ngeeninsiirron avulla on merkitt\u00e4v\u00e4 ja kasvava maailmanlaajuinen ongelma\nihmisten terveydelle. Siirt\u00e4m\u00e4ll\u00e4 konjugaation avulla laajakirjoisia \u03b2-laktamaasi\n(ESBL)\u2013geenej\u00e4 tuottavia plasmideja vastustuskykyiset bakteerikannat pystyv\u00e4t\npelastamaan antibiooteille alttiita bakteereja my\u00f6s tappavassa\nantibioottialtistuksessa. T\u00e4m\u00e4 tutkimus pyrkii selvitt\u00e4m\u00e4\u00e4n mik\u00e4 on bakteerien\nymp\u00e4rist\u00f6n ravinnepitoisuuden vaikutus t\u00e4h\u00e4n pelastuskykyyn. Viitt\u00e4 eri ESBLplasmideja\nsis\u00e4lt\u00e4v\u00e4\u00e4 JM109 E.coli-kantaa kasvatettiin yhdess\u00e4 ampisilliinille alttiin\nHMS174 E.coli-kannan kanssa 5% ja 100% ravinnetasossa sek\u00e4 ilman antibioottia,\nett\u00e4 tappavassa ampisilliinikonsentraatiossa. Ampisilliinivastustuskyvyn\nsiirtymist\u00e4 ESBL-plasmidien mukana tutkittiin kasvattamalla n\u00e4ytteit\u00e4\nkasvatuksista ampisilliini\u00e4 ja rifampisiini\u00e4 sis\u00e4lt\u00e4vill\u00e4 maljoilla joilla vain ESBLplasmidin\nsis\u00e4lt\u00e4v\u00e4t HMS174 transkonjugantit pystyv\u00e4t kasvamaan. Tulokset\nosoittivat ett\u00e4 eri plasmidien kyky siirty\u00e4 bakteerikantojen v\u00e4lill\u00e4 vaihtelee\nmerkitt\u00e4v\u00e4sti. Ravinteiden m\u00e4\u00e4r\u00e4, antibioottivalinta ja plasmidien ominaisuudet,\nkuten niiden koko, vaikuttavat voimakkaasti konjugaatiotehokkuuteen.\nTutkimuksen tulokset voivat auttaa ymm\u00e4rt\u00e4m\u00e4\u00e4n antibioottiresistenssin\nevoluutiota ESBL-bakteerien infektoimissa potilaissa.", "language": "fi", "element": "description", "qualifier": "abstract", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.abstract", "value": "The spread of antibiotic resistance between bacterial strains by plasmid-mediated\nconjugative horizontal gene transfer is a significant and growing global threat to\nhuman welfare. Resistant bacterial strains can rescue susceptible bacteria by\nconjugative transfer of extended spectrum \u03b2-lactamase (ESBL)-genes containing\nplasmids in lethal antibiotic concentrations. This study aims to investigate how the\nnutritional level of the environment effects this rescue potential. Five different\nESBL-plasmid containig JM109 E.coli-srains were grown together with an ampicillin\nsusceptible HMS174 E.coli-strain in 5% and 100% nutritional levels with and\nwithout antibiotic selection. The transfer of ampicillin resistance was studied by\ngrowing samples on plates containig ampicillin and rifampicin, on which only the\nESBL-plasmid containing HMS174 transconjugants could grow. The ability of these\nplasmids to transfer themselves conjugatively between bacterial strains varied\nsignificantly. The amount of nutrients, antibiotic selection and the properties of the\nplasmids, such as their size, have a stong effect on the efficiency of conjugational\ngene transfer. The results of the study may help to understand the evolution of\nresistance in patients infected by ESBL-bacteria.", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "abstract", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Submitted by Paivi Vuorio (paelvuor@jyu.fi) on 2019-12-18T06:49:45Z\nNo. of bitstreams: 0", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Made available in DSpace on 2019-12-18T06:49:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0\n Previous issue date: 2019", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.extent", "value": "26", "language": "", "element": "format", "qualifier": "extent", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.mimetype", "value": "application/pdf", "language": null, "element": "format", "qualifier": "mimetype", "schema": "dc"}, {"key": "dc.language.iso", "value": "fin", "language": null, "element": "language", "qualifier": "iso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights", "value": "In Copyright", "language": "en", "element": "rights", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "konjugatiivinen plasmidi", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "vastustuskykygeeni", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.title", "value": "Ymp\u00e4rist\u00f6n ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla", "language": "", "element": "title", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.type", "value": "master thesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.urn", "value": "URN:NBN:fi:jyu-201912185369", "language": "", "element": "identifier", "qualifier": "urn", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Pro gradu -tutkielma", "language": "fi", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Master\u2019s thesis", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Faculty of Sciences", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Bio- ja ymp\u00e4rist\u00f6tieteiden laitos", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Department of Biological and Environmental Science", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "Jyv\u00e4skyl\u00e4n yliopisto", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "University of Jyv\u00e4skyl\u00e4", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Solu- ja molekyylibiologia", "language": "fi", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Cell and molecular biology", "language": "en", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "yvv.contractresearch.funding", "value": "0", "language": "", "element": "contractresearch", "qualifier": "funding", "schema": "yvv"}, {"key": "dc.type.coar", "value": "http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc", "language": null, "element": "type", "qualifier": "coar", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.accesslevel", "value": "openAccess", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "accesslevel", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.publication", "value": "masterThesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": "publication", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.oppiainekoodi", "value": "4013", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "oppiainekoodi", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "antibiootit", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "plasmidit", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "horisontaalinen geeninsiirto", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "resistenssi", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "ravinnepitoisuus", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.content", "value": "fulltext", "language": null, "element": "format", "qualifier": "content", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.url", "value": "https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "url", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.okm", "value": "G2", "language": null, "element": "type", "qualifier": "okm", "schema": "dc"}]
id jyx.123456789_66894
language fin
last_indexed 2025-02-18T10:55:08Z
main_date 2019-01-01T00:00:00Z
main_date_str 2019
online_boolean 1
online_urls_str_mv {"url":"https:\/\/jyx.jyu.fi\/bitstreams\/dcf6f8c0-5f2e-4d67-9f0d-c9ba8009c4c0\/download","text":"URN:NBN:fi:jyu-201912185369.pdf","source":"jyx","mediaType":"application\/pdf"}
publishDate 2019
record_format qdc
source_str_mv jyx
spellingShingle Tuononen, Timo Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla konjugatiivinen plasmidi vastustuskykygeeni Solu- ja molekyylibiologia Cell and molecular biology 4013 antibiootit plasmidit horisontaalinen geeninsiirto resistenssi ravinnepitoisuus
title Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
title_full Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
title_fullStr Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
title_full_unstemmed Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
title_short Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
title_sort ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten esbl plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
title_txtP Ympäristön ravinnepitoisuuden vaikutus konjugatiivisten ESBL-plasmidien kykyyn pelastaa antibiooteille alttiita bakteereja tappavassa antibioottipitoisuudessa horisontaalisen geeninsiirron avulla
topic konjugatiivinen plasmidi vastustuskykygeeni Solu- ja molekyylibiologia Cell and molecular biology 4013 antibiootit plasmidit horisontaalinen geeninsiirto resistenssi ravinnepitoisuus
topic_facet 4013 Cell and molecular biology Solu- ja molekyylibiologia antibiootit horisontaalinen geeninsiirto konjugatiivinen plasmidi plasmidit ravinnepitoisuus resistenssi vastustuskykygeeni
url https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/66894 http://www.urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201912185369
work_keys_str_mv AT tuononentimo ympäristönravinnepitoisuudenvaikutuskonjugatiivistenesblplasmidienkykyynpelastaaant