Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi

Tutkielman kirjallisessa osassa perehdytään bakteerin soluseinän biosynteesin, peptidoglykaanin hajottamiseen, puhdistamiseen sekä karakterisointiin. Kokeellisessa osassa valmistettiin kahta lähtöainetta, joita voidaan käyttää lysostafiinientsyymin siirtymätila-analogin valmistamisessa. Valmistetutu...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Ojala, Alexandra
Other Authors: Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta, Faculty of Sciences, Kemian laitos, Department of Chemistry, Jyväskylän yliopisto, University of Jyväskylä
Format: Master's thesis
Language:fin
Published: 2019
Subjects:
Online Access: https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/64745
_version_ 1828193082962608128
author Ojala, Alexandra
author2 Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Kemian laitos Department of Chemistry Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä
author_facet Ojala, Alexandra Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Kemian laitos Department of Chemistry Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä Ojala, Alexandra Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta Faculty of Sciences Kemian laitos Department of Chemistry Jyväskylän yliopisto University of Jyväskylä
author_sort Ojala, Alexandra
datasource_str_mv jyx
description Tutkielman kirjallisessa osassa perehdytään bakteerin soluseinän biosynteesin, peptidoglykaanin hajottamiseen, puhdistamiseen sekä karakterisointiin. Kokeellisessa osassa valmistettiin kahta lähtöainetta, joita voidaan käyttää lysostafiinientsyymin siirtymätila-analogin valmistamisessa. Valmistetutut komponentit olivat suojattu aminometyylihypofosforihapoke sekä N-akryloyyliglysinaatti. Peptidoglykaanin biosynteesiä käydään läpi aloittaen sytoplasmassa tapahtuvista reaktioista siirtyen aikajanalla eteenpäin solukalvon sisäreunalla ja sen ulkopuolella tapahtuviin reaktioihin. Kussakin vaiheessa käydään läpi reaktioita mahdollistavat entsyymit. Biosynteesin tarkastelu päätetään ristisiltoja muodostavien entsyymien toimintaan. Peptidoglykaanin hajottamisesta käydään läpi niin autolysiinien kuin antibioottienkin toiminta. Useat antibiootit estävätkin juuri biosynteesissä vaikuttavien entsyymien toimintaan. Peptidoglykaanin tutkimuksesta perehdytään peptidoglykaanin eristämiseen ja puhdistukseen, sekä erilaisiin menetelmiin, joita käyttäen voidaan karakterisoida sen rakennetta. Usein peptidoglykaani erotetaan muista soluseinän osista ja hajotetaan liukenevaan muotoon. On myös olemassa analyysimenetelmiä, joilla voidaan tutkia liukenematonta peptidoglykaania. Erikokoisia peptidoglykaanifragmentteja on myös mahdollista valmistaa. Peptidoglykaanin rakenteen ja siihen vaikuttavien entsyymien tutkiminen on tärkeää sillä, ne ovat potentiaalisia kohteita esimerkiksi uusille antibiooteille. Entsyymejä voidaan tutkia siirtymätila-analogien avulla. Ymmärtämällä entsyymien toimintamekanismeja on mahdollista kehittää parempia inhibiittoreita tai uusia entsyymien kaltaisia molekyylejä, jotka voivat katalysoida haluttuja reaktiota.
first_indexed 2019-08-19T08:21:47Z
format Pro gradu
free_online_boolean 1
fullrecord [{"key": "dc.contributor.advisor", "value": "Siev\u00e4nen, Elina", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "advisor", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.advisor", "value": "Permi, Perttu", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "advisor", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.author", "value": "Ojala, Alexandra", "language": "", "element": "contributor", "qualifier": "author", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.accessioned", "value": "2019-06-20T06:36:57Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "accessioned", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.available", "value": "2019-06-20T06:36:57Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "available", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.issued", "value": "2019", "language": "", "element": "date", "qualifier": "issued", "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.uri", "value": "https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/64745", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "uri", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.abstract", "value": "Tutkielman kirjallisessa osassa perehdyt\u00e4\u00e4n bakteerin solusein\u00e4n biosynteesin, peptidoglykaanin hajottamiseen, puhdistamiseen sek\u00e4 karakterisointiin. Kokeellisessa osassa valmistettiin kahta l\u00e4ht\u00f6ainetta, joita voidaan k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 lysostafiinientsyymin siirtym\u00e4tila-analogin valmistamisessa. Valmistetutut komponentit olivat suojattu aminometyylihypofosforihapoke sek\u00e4 N-akryloyyliglysinaatti.\n\nPeptidoglykaanin biosynteesi\u00e4 k\u00e4yd\u00e4\u00e4n l\u00e4pi aloittaen sytoplasmassa tapahtuvista reaktioista siirtyen aikajanalla eteenp\u00e4in solukalvon sis\u00e4reunalla ja sen ulkopuolella tapahtuviin reaktioihin. Kussakin vaiheessa k\u00e4yd\u00e4\u00e4n l\u00e4pi reaktioita mahdollistavat entsyymit. Biosynteesin tarkastelu p\u00e4\u00e4tet\u00e4\u00e4n ristisiltoja muodostavien entsyymien toimintaan. Peptidoglykaanin hajottamisesta k\u00e4yd\u00e4\u00e4n l\u00e4pi niin autolysiinien kuin antibioottienkin toiminta. Useat antibiootit est\u00e4v\u00e4tkin juuri biosynteesiss\u00e4 vaikuttavien entsyymien toimintaan. \n\nPeptidoglykaanin tutkimuksesta perehdyt\u00e4\u00e4n peptidoglykaanin erist\u00e4miseen ja puhdistukseen, sek\u00e4 erilaisiin menetelmiin, joita k\u00e4ytt\u00e4en voidaan karakterisoida sen rakennetta. Usein peptidoglykaani erotetaan muista solusein\u00e4n osista ja hajotetaan liukenevaan muotoon. On my\u00f6s olemassa analyysimenetelmi\u00e4, joilla voidaan tutkia liukenematonta peptidoglykaania. Erikokoisia peptidoglykaanifragmentteja on my\u00f6s mahdollista valmistaa.\n\nPeptidoglykaanin rakenteen ja siihen vaikuttavien entsyymien tutkiminen on t\u00e4rke\u00e4\u00e4 sill\u00e4, ne ovat potentiaalisia kohteita esimerkiksi uusille antibiooteille. Entsyymej\u00e4 voidaan tutkia siirtym\u00e4tila-analogien avulla. Ymm\u00e4rt\u00e4m\u00e4ll\u00e4 entsyymien toimintamekanismeja on mahdollista kehitt\u00e4\u00e4 parempia inhibiittoreita tai uusia entsyymien kaltaisia molekyylej\u00e4, jotka voivat katalysoida haluttuja reaktiota.", "language": "fi", "element": "description", "qualifier": "abstract", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Submitted by Paivi Vuorio (paelvuor@jyu.fi) on 2019-06-20T06:36:57Z\nNo. of bitstreams: 0", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Made available in DSpace on 2019-06-20T06:36:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0\n Previous issue date: 2019", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.extent", "value": "84", "language": "", "element": "format", "qualifier": "extent", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.mimetype", "value": "application/pdf", "language": null, "element": "format", "qualifier": "mimetype", "schema": "dc"}, {"key": "dc.language.iso", "value": "fin", "language": null, "element": "language", "qualifier": "iso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights", "value": "In Copyright", "language": "en", "element": "rights", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "peptidoglykaani", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "siirtym\u00e4tila-analogi", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.title", "value": "Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi", "language": "", "element": "title", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.type", "value": "master thesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.urn", "value": "URN:NBN:fi:jyu-201906203333", "language": "", "element": "identifier", "qualifier": "urn", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Pro gradu -tutkielma", "language": "fi", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Master\u2019s thesis", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Faculty of Sciences", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Kemian laitos", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Department of Chemistry", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "Jyv\u00e4skyl\u00e4n yliopisto", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "University of Jyv\u00e4skyl\u00e4", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Orgaaninen kemia", "language": "fi", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Organic Chemistry", "language": "en", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "yvv.contractresearch.funding", "value": "0", "language": "", "element": "contractresearch", "qualifier": "funding", "schema": "yvv"}, {"key": "dc.type.coar", "value": "http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc", "language": null, "element": "type", "qualifier": "coar", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.accesslevel", "value": "openAccess", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "accesslevel", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.publication", "value": "masterThesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": "publication", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.oppiainekoodi", "value": "4035", "language": "", "element": "subject", "qualifier": "oppiainekoodi", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "bakteerit", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "antibiootit", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "entsyymit", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "solusein\u00e4t", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "biosynteesi", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "hajotus", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "puhdistus", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.content", "value": "fulltext", "language": null, "element": "format", "qualifier": "content", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.url", "value": "https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "url", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.okm", "value": "G2", "language": null, "element": "type", "qualifier": "okm", "schema": "dc"}]
id jyx.123456789_64745
language fin
last_indexed 2025-03-31T20:02:44Z
main_date 2019-01-01T00:00:00Z
main_date_str 2019
online_boolean 1
online_urls_str_mv {"url":"https:\/\/jyx.jyu.fi\/bitstreams\/0415169a-fbd3-4fcd-9317-d9832ce13f7f\/download","text":"URN:NBN:fi:jyu-201906203333.pdf","source":"jyx","mediaType":"application\/pdf"}
publishDate 2019
record_format qdc
source_str_mv jyx
spellingShingle Ojala, Alexandra Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi peptidoglykaani siirtymätila-analogi Orgaaninen kemia Organic Chemistry 4035 bakteerit antibiootit entsyymit soluseinät biosynteesi hajotus puhdistus
title Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
title_full Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
title_fullStr Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
title_full_unstemmed Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
title_short Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
title_sort peptidoglykaanin hajottaminen puhdistus ja karakterisointi
title_txtP Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
topic peptidoglykaani siirtymätila-analogi Orgaaninen kemia Organic Chemistry 4035 bakteerit antibiootit entsyymit soluseinät biosynteesi hajotus puhdistus
topic_facet 4035 Orgaaninen kemia Organic Chemistry antibiootit bakteerit biosynteesi entsyymit hajotus peptidoglykaani puhdistus siirtymätila-analogi soluseinät
url https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/64745 http://www.urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201906203333
work_keys_str_mv AT ojalaalexandra peptidoglykaaninhajottaminenpuhdistusjakarakterisointi