fullrecord |
[{"key": "dc.contributor.author", "value": "Haapaniemi, Teppo", "language": null, "element": "contributor", "qualifier": "author", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.accessioned", "value": "2010-10-10T11:50:20Z", "language": "", "element": "date", "qualifier": "accessioned", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.available", "value": "2010-10-10T11:50:20Z", "language": "", "element": "date", "qualifier": "available", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.issued", "value": "2010", "language": null, "element": "date", "qualifier": "issued", "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.other", "value": "oai:jykdok.linneanet.fi:1137705", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.uri", "value": "https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/25468", "language": "", "element": "identifier", "qualifier": "uri", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.abstract", "value": "Ihmist\u00e4 infektoivat enterovirukset luokitellaan ihmisen enterovirus A-, B-, C- ja D -lajeihin sek\u00e4 rinoviruslajeihin. N\u00e4m\u00e4 lajit sis\u00e4lt\u00e4v\u00e4t runsaasti alalajeja, joita tunnetaankin yli 200. Enterovirus on pieni, ikosahedraalinen, genomiltaan yksijuosteinen ja positiiviss\u00e4ikeinen RNA-virus, joka on yleinen taudinaiheuttaja kaikissa ik\u00e4ryhmiss\u00e4. Enterovirusinfektioiden ep\u00e4ill\u00e4\u00e4n olevan monien autoimmuunisairauksien patogeneesin taustalla. Enteroviruksia pidet\u00e4\u00e4n todenn\u00e4k\u00f6isimp\u00e4n\u00e4 tyypin 1 diabetesta (T1D) aiheuttavana virussukuna, sill\u00e4\r\nenterovirusinfektioita on todettu diabeetikoilta terveit\u00e4 useammin monissa eri tutkimuksissa. Vaikka enterovirusinfektiot on yhdistetty T1D:n patogeneesiin, ei enterovirusten osuutta sairauden puhkeamisessa ole kyetty t\u00e4ysin todistamaan. Enterovirusten ja T1D:n v\u00e4lisen epidemiologisen yhteyden osoittaminen on haastavaa,\r\nsill\u00e4 tutkimuksia vaikeuttavat T1D:n oireeton, jopa vuosia kest\u00e4v\u00e4 esivaihe sek\u00e4 haimakudosn\u00e4ytteiden heikko saatavuus. Vaikka enterovirusdetektiossa immunohistokemialliset menetelm\u00e4t (IHC) ja in situ -hybridisaatio(ISH) ovat osoittautuneet toimiviksi formaliinifiksattuja kudosn\u00e4ytteit\u00e4 k\u00e4ytett\u00e4ess\u00e4, tulee n\u00e4it\u00e4 menetelmi\u00e4 edelleen kehitt\u00e4\u00e4 detektion luotettavuuden varmistamiseksi. Tutkielman tarkoituksena oli vahvistaa enterovirusdetektion luotettavuutta suunnittelemillamme lajispesifisill\u00e4 koettimilla sek\u00e4 omassa laboratoriossamme\r\ntuotetuilla polyklonaalisilla enterovirusvasta-aineilla ja arvioida n\u00e4iden soveltuvuutta enterovirusdetektioon haimakudoksesta. Tutkielman tarkoituksena oli my\u00f6s selvent\u00e4\u00e4 tietoa enterovirusten is\u00e4nt\u00e4soluspesifisyydest\u00e4 ihmisen haimakudoksessa. Tutkimuksessa n\u00e4ytemateriaalina k\u00e4ytettiin formaliinifiksattuja ja\r\nparafiiniin valettuja ihmisten haimakudosleikkeit\u00e4 ja Balb/c-hiirten monikudosleikkeit\u00e4. Enterovirusvastaaineina k\u00e4ytettiin polyklonaalisia kanin vasta-aineita, jotka olivat suunniteltu coxsackievirus A16 (CAV16)-, coxsackievirus B3 (CBV3)- ja echovirus 11 -spesifisiksi. Tutkimuksessa k\u00e4ytettiin ISH-menetelm\u00e4\u00e4 sek\u00e4\r\nkahta erilaista IHC-menetelm\u00e4\u00e4: immunoperoksidaasiv\u00e4rj\u00e4yst\u00e4 sek\u00e4 immunofluoresenssiin perustuvaa kaksoisv\u00e4rj\u00e4yst\u00e4 (IFA). Immunoperoksidaasiv\u00e4rj\u00e4yksen avulla seulottiin enteroviruksia ihmisen haimakudosleikkeist\u00e4 (n=12). Viruspositiivisuutta l\u00f6ydettiin kolmesta haimakudoksesta CAV16 spesifisell\u00e4 vasta-aineella. CBV3- ja Echo11 -vasta-aineilla positiivisuutta ei l\u00f6ydetty. CAV16 saarekesoluspesifisyyden m\u00e4\u00e4ritt\u00e4miseksi\r\nIFA toteutettiin k\u00e4ytt\u00e4en CAV16 vasta-ainetta sek\u00e4 kaupallisia vasta-aineita saarekesoluspesifisi\u00e4 peptidihormoneja insuliinia, glukagonia ja somatostatiinia vastaan. ISH-m\u00e4\u00e4rityst\u00e4 varten enteroviruslajispesifiset DNA-koettimet suunniteltiin sitoutumaan enterovirusgenomin konservoituneille 2C- ja 3D -geenialueille. Lis\u00e4ksi suunniteltiin koetin, joka sitoutuu enteroviruksen negatiiviseen RNA-juosteeseen, jota virus k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 templaattina replikaatiossaan. ISH-menetelm\u00e4 optimoitiin CBV3 infektoidun Balb/c -hiiren kudosleikkeill\u00e4.\r\nIFA:n mukaan CAV16 infektio rajoittuu haimakudoksessa ainoastaan saarekkeiden insuliinia tuottaviin \u03b2-soluihin ja tulokset tukevat yleist\u00e4 k\u00e4sityst\u00e4 enterovirusinfektion \u03b2-soluspesifisyydest\u00e4. L\u00f6yt\u00f6 on merkitt\u00e4v\u00e4 sill\u00e4 CAV16 saarekesoluspesifisyytt\u00e4 ei ole aiemmin osoitettu. Ainoastaan enterovirus B-lajispesifiset koettimet sek\u00e4 enteroviruksen negatiiviseen juosteeseen sitoutuva koetin, tunnistivat CBV3-virusta hiiren haimakudoksesta, mik\u00e4 viittaa lajispesifiseen hybridisoitumiseen. Koettimien yht\u00e4aikainen k\u00e4ytt\u00f6 samassa ISH-reaktiossa ei h\u00e4irinnyt enterovirus B-lajispesifisten koettimien hybridisoitumista. Itsesuunnitellut koettimet sek\u00e4 itsetuotetut vasta-aineet lis\u00e4\u00e4v\u00e4t enterovirusdetektion luotettavuutta merkitt\u00e4v\u00e4sti, varsinkin jos niit\u00e4\r\nk\u00e4ytet\u00e4\u00e4n kaupallisten koettimien ja vasta-aineiden rinnalla.", "language": "", "element": "description", "qualifier": "abstract", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Submitted using Plone Publishing form by Teppo Haapaniemi (tejahaap) on 2010-10-10 11:50:17.435543. Form: Pro gradu -lomake (1 tekij\u00e4) (https://kirjasto.jyu.fi/julkaisut/julkaisulomakkeet/pro-gradu-lomake-1-tekijae). JyX data:", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Submitted by jyx lomake-julkaisija (jyx-julkaisija@noreply.fi) on 2010-10-10T11:50:20Z\r\nNo. of bitstreams: 2\r\nURN:NBN:fi:jyu-201010102972.pdf: 2464644 bytes, checksum: 0a8781cb4d85ac54f9627eadc08d650e (MD5)\r\nlicense.html: 5075 bytes, checksum: 306c9444b6dabf5476c36a93fe58ad30 (MD5)", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Made available in DSpace on 2010-10-10T11:50:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2\r\nURN:NBN:fi:jyu-201010102972.pdf: 2464644 bytes, checksum: 0a8781cb4d85ac54f9627eadc08d650e (MD5)\r\nlicense.html: 5075 bytes, checksum: 306c9444b6dabf5476c36a93fe58ad30 (MD5)\r\n Previous issue date: 2010", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.extent", "value": "91 sivua", "language": null, "element": "format", "qualifier": "extent", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.mimetype", "value": "application/pdf", "language": null, "element": "format", "qualifier": "mimetype", "schema": "dc"}, {"key": "dc.language.iso", "value": "fin", "language": null, "element": "language", "qualifier": "iso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights", "value": "In Copyright", "language": "en", "element": "rights", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.title", "value": "Enterovirusten detektio haimakudoksesta in situ -hybridisaatiolla ja immunofluoresenssiinperustuvalla kaksoisv\u00e4rj\u00e4ysmenetelm\u00e4ll\u00e4", "language": null, "element": "title", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.type", "value": "master thesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.urn", "value": "URN:NBN:fi:jyu-201010102972", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "urn", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.dcmitype", "value": "Text", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "dcmitype", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Pro gradu -tutkielma", "language": "fi", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Master\u2019s thesis", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Faculty of Sciences", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Bio- ja ymp\u00e4rist\u00f6tieteiden laitos", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Department of Biological and Environmental Science", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "University of Jyv\u00e4skyl\u00e4", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "Jyv\u00e4skyl\u00e4n yliopisto", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Solu- ja molekyylibiologia", "language": "fi", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Cell and molecular biology", "language": "en", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.coar", "value": "http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc", "language": null, "element": "type", "qualifier": "coar", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.accesslevel", "value": "openAccess", "language": "fi", "element": "rights", "qualifier": "accesslevel", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.publication", "value": "masterThesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": "publication", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.oppiainekoodi", "value": "4013", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "oppiainekoodi", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "enterovirukset", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.yso", "value": "diabetes", "language": null, "element": "subject", "qualifier": "yso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.content", "value": "fulltext", "language": null, "element": "format", "qualifier": "content", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.url", "value": "https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "url", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.okm", "value": "G2", "language": null, "element": "type", "qualifier": "okm", "schema": "dc"}]
|