Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky

Pullinen, Katri 2007. Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky. Liikuntabiologian laitos, Jyväskylän yliopisto. Liikuntafysiologian Kandidaatin tutkielma, 49 s. Perinnöllistä kestävyyssuorituskykyä ja kestävyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita voidaan tutkia geen...

Täydet tiedot

Bibliografiset tiedot
Päätekijä: Pullinen, Katri
Muut tekijät: Liikuntatieteellinen tiedekunta, Faculty of Sport and Health Sciences, Liikuntabiologian laitos, University of Jyväskylä, Jyväskylän yliopisto
Aineistotyyppi: Kandityö
Kieli:fin
Julkaistu: 2007
Aiheet:
Linkit: https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/19899
_version_ 1828193216854228992
author Pullinen, Katri
author2 Liikuntatieteellinen tiedekunta Faculty of Sport and Health Sciences Liikuntabiologian laitos University of Jyväskylä Jyväskylän yliopisto
author_facet Pullinen, Katri Liikuntatieteellinen tiedekunta Faculty of Sport and Health Sciences Liikuntabiologian laitos University of Jyväskylä Jyväskylän yliopisto Pullinen, Katri Liikuntatieteellinen tiedekunta Faculty of Sport and Health Sciences Liikuntabiologian laitos University of Jyväskylä Jyväskylän yliopisto
author_sort Pullinen, Katri
datasource_str_mv jyx
description Pullinen, Katri 2007. Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky. Liikuntabiologian laitos, Jyväskylän yliopisto. Liikuntafysiologian Kandidaatin tutkielma, 49 s. Perinnöllistä kestävyyssuorituskykyä ja kestävyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita voidaan tutkia geeniekspressiotasolla tekemällä microarray-analyysi. Kestävyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita tutkittaessa on havaittu muun muassa mitokondrioiden biogeneesiin ja metaboliaan liittyvien geenien ilmenemisen kasvua. Kestävyyssuorituskyvyn perinnöllisyyttä ei ole tutkittu geeniekspressiotasolla ihmisillä eikä eläimillä. Ihmisillä se on erittäin hankalaa, joten sitä varten voidaan luoda eläinkantoja, joissa geneettinen ja ympäristön vaihtelu on minimoitu. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää, minkälaisia eroja löytyy perinnöllisesti korkean ja matalan juoksukapasiteetin rottien, jotka eivät harjoitelleet, luurankolihaksen geenien ilmenemisessä ja mitkä geenit tai geeniryhmät ovat yhteydessä kestävyyssuorituskykyyn. Koe-eläiminä oli geneettisesti heterogeenisten rottien (N:NIH kanta) jälkeläisiä. 12 korkean (HCR) ja 12 matalan (LCR) juoksukapasiteetin rotan m. gastrocnemiuksesta otettiin näyte microarray-analyysiä varten. Microarray-analyysissä käytettiin Illuminan RatRef-12 Expression BeadChip sirua ja tulokset analysoitiin R-kielellä ja Bioconductorin siihen lisäämillä paketeilla. Jokaiselle geenille laskettiin intensiteettiarvojen keskiarvo, keskihajonta ja kertamuutos. Kiinnostavat geenit suodatettiin perustuen muokattuun P-arvoon. Annotaatiossa käytettiin DAVID bioinformatiikka webtyökalua ja muita internetin geenitietokantasivustoja. Geenien ilmenemismuutosten määrä ja suunta laskettiin merkitsevyystasoilla 0,01, 0,05, 0,1, 0,15, 0,2 ja 0,25. Merkitsevyystasolla 0,01 31 geenin ekspressio oli kasvanut ja 23 geenin ekspressio laskenut. Suurin osa muutoksista tapahtui pienillä intensiteeteillä ja moni näistä muutoksista oli melko pieni. Merkitsevyystasolla 0,05 geenit luokiteltiin eri ryhmiin. Geenien ilmeneminen oli suurempaa HCR rotilla mitokondrioon, karboksyylihappometaboliaan, lipidimetaboliaan, oksidoreduktaasiaktiivisuuteen ja immuunivasteeseen liittyvissä geeneissä. Geenien ilmeneminen oli suurempaa LCR rotilla lipidikataboliaan, solujen tukirangan proteiinien sitoutumiseen ja proteiinimetaboliaan liittyvissä geeneissä. Tutkimuksessa havaitut geeniekspressioerot HCR ja LCR rottien välillä selittävät eroja kestävyyssuorituskyvyssä. Suuremmat ilmenemistasot lipidimetaboliaan liittyvillä geeneillä kertovat paremmasta rasvojen hajotuskyvystä ja rasvahappojen nopeammasta ja tehokkaammasta hapetuksesta, jolloin rasvoja pystytään käyttämään paremmin energianlähteenä. Myös mitokondrioiden kyky tuottaa ATP:ta on parempi, mistä kertoo sitruunahappokierron ja elektroninsiirtoketjun geenien ekspression kasvu.
first_indexed 2024-09-11T08:51:02Z
format Kandityö
free_online_boolean 1
fullrecord [{"key": "dc.contributor.author", "value": "Pullinen, Katri", "language": null, "element": "contributor", "qualifier": "author", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.accessioned", "value": "2009-04-14T14:41:30Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "accessioned", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.available", "value": "2009-04-14T14:41:30Z", "language": null, "element": "date", "qualifier": "available", "schema": "dc"}, {"key": "dc.date.issued", "value": "2007", "language": null, "element": "date", "qualifier": "issued", "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.uri", "value": "https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/19899", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "uri", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.abstract", "value": "Pullinen, Katri 2007. Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinn\u00f6llinen kest\u00e4vyyssuorituskyky. Liikuntabiologian laitos, Jyv\u00e4skyl\u00e4n yliopisto. Liikuntafysiologian Kandidaatin tutkielma, 49 s. Perinn\u00f6llist\u00e4 kest\u00e4vyyssuorituskyky\u00e4 ja kest\u00e4vyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita voidaan tutkia geeniekspressiotasolla tekem\u00e4ll\u00e4 microarray-analyysi. Kest\u00e4vyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita tutkittaessa on havaittu muun muassa mitokondrioiden biogeneesiin ja metaboliaan liittyvien geenien ilmenemisen kasvua. Kest\u00e4vyyssuorituskyvyn perinn\u00f6llisyytt\u00e4 ei ole tutkittu geeniekspressiotasolla ihmisill\u00e4 eik\u00e4 el\u00e4imill\u00e4. Ihmisill\u00e4 se on eritt\u00e4in hankalaa, joten sit\u00e4 varten voidaan luoda el\u00e4inkantoja, joissa geneettinen ja ymp\u00e4rist\u00f6n vaihtelu on minimoitu. T\u00e4m\u00e4n tutkimuksen tarkoituksena oli selvitt\u00e4\u00e4, mink\u00e4laisia eroja l\u00f6ytyy perinn\u00f6llisesti korkean ja matalan juoksukapasiteetin rottien, jotka eiv\u00e4t harjoitelleet, luurankolihaksen geenien ilmenemisess\u00e4 ja mitk\u00e4 geenit tai geeniryhm\u00e4t ovat yhteydess\u00e4 kest\u00e4vyyssuorituskykyyn. Koe-el\u00e4imin\u00e4 oli geneettisesti heterogeenisten rottien (N:NIH kanta) j\u00e4lkel\u00e4isi\u00e4. 12 korkean (HCR) ja 12 matalan (LCR) juoksukapasiteetin rotan m. gastrocnemiuksesta otettiin n\u00e4yte microarray-analyysi\u00e4 varten. Microarray-analyysiss\u00e4 k\u00e4ytettiin Illuminan RatRef-12 Expression BeadChip sirua ja tulokset analysoitiin R-kielell\u00e4 ja Bioconductorin siihen lis\u00e4\u00e4mill\u00e4 paketeilla. Jokaiselle geenille laskettiin intensiteettiarvojen keskiarvo, keskihajonta ja kertamuutos. Kiinnostavat geenit suodatettiin perustuen muokattuun P-arvoon. Annotaatiossa k\u00e4ytettiin DAVID bioinformatiikka webty\u00f6kalua ja muita internetin geenitietokantasivustoja. Geenien ilmenemismuutosten m\u00e4\u00e4r\u00e4 ja suunta laskettiin merkitsevyystasoilla 0,01, 0,05, 0,1, 0,15, 0,2 ja 0,25. Merkitsevyystasolla 0,01 31 geenin ekspressio oli kasvanut ja 23 geenin ekspressio laskenut. Suurin osa muutoksista tapahtui pienill\u00e4 intensiteeteill\u00e4 ja moni n\u00e4ist\u00e4 muutoksista oli melko pieni. Merkitsevyystasolla 0,05 geenit luokiteltiin eri ryhmiin. Geenien ilmeneminen oli suurempaa HCR rotilla mitokondrioon, karboksyylihappometaboliaan, lipidimetaboliaan, oksidoreduktaasiaktiivisuuteen ja immuunivasteeseen liittyviss\u00e4 geeneiss\u00e4. Geenien ilmeneminen oli suurempaa LCR rotilla lipidikataboliaan, solujen tukirangan proteiinien sitoutumiseen ja proteiinimetaboliaan liittyviss\u00e4 geeneiss\u00e4. Tutkimuksessa havaitut geeniekspressioerot HCR ja LCR rottien v\u00e4lill\u00e4 selitt\u00e4v\u00e4t eroja kest\u00e4vyyssuorituskyvyss\u00e4. Suuremmat ilmenemistasot lipidimetaboliaan liittyvill\u00e4 geeneill\u00e4 kertovat paremmasta rasvojen hajotuskyvyst\u00e4 ja rasvahappojen nopeammasta ja tehokkaammasta hapetuksesta, jolloin rasvoja pystyt\u00e4\u00e4n k\u00e4ytt\u00e4m\u00e4\u00e4n paremmin energianl\u00e4hteen\u00e4. My\u00f6s mitokondrioiden kyky tuottaa ATP:ta on parempi, mist\u00e4 kertoo sitruunahappokierron ja elektroninsiirtoketjun geenien ekspression kasvu.", "language": "en_US", "element": "description", "qualifier": "abstract", "schema": "dc"}, {"key": "dc.description.provenance", "value": "Made available in DSpace on 2009-04-14T14:41:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1\r\nCL Pullinen.pdf: 479307 bytes, checksum: a23f3ff9f9636f54b7fd9c98893d9b72 (MD5)\r\n Previous issue date: 2007", "language": "en", "element": "description", "qualifier": "provenance", "schema": "dc"}, {"key": "dc.format.extent", "value": "49 s.", "language": null, "element": "format", "qualifier": "extent", "schema": "dc"}, {"key": "dc.language.iso", "value": "fin", "language": null, "element": "language", "qualifier": "iso", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights", "value": "In Copyright", "language": "en", "element": "rights", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "kest\u00e4vyyssuorituskyky", "language": "en_US", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "luurankolihas", "language": "en_US", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "geeniekspressio", "language": "en_US", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.other", "value": "perinn\u00f6llisyys", "language": "en_US", "element": "subject", "qualifier": "other", "schema": "dc"}, {"key": "dc.title", "value": "Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinn\u00f6llinen kest\u00e4vyyssuorituskyky", "language": null, "element": "title", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.type", "value": "bachelor thesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": null, "schema": "dc"}, {"key": "dc.identifier.urn", "value": "URN:NBN:fi:jyu-20094141436", "language": null, "element": "identifier", "qualifier": "urn", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.dcmitype", "value": "Text", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "dcmitype", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Bachelor's thesis", "language": "en", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.ontasot", "value": "Kandidaatintutkielma", "language": "fi", "element": "type", "qualifier": "ontasot", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Liikuntatieteellinen tiedekunta", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.faculty", "value": "Faculty of Sport and Health Sciences", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "faculty", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.department", "value": "Liikuntabiologian laitos", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "department", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "University of Jyv\u00e4skyl\u00e4", "language": "en", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.contributor.organization", "value": "Jyv\u00e4skyl\u00e4n yliopisto", "language": "fi", "element": "contributor", "qualifier": "organization", "schema": "dc"}, {"key": "dc.subject.discipline", "value": "Liikuntafysiologia", "language": "fi", "element": "subject", "qualifier": "discipline", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.coar", "value": "http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f", "language": null, "element": "type", "qualifier": "coar", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.accesslevel", "value": "openAccess", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "accesslevel", "schema": "dc"}, {"key": "dc.type.publication", "value": "bachelorThesis", "language": null, "element": "type", "qualifier": "publication", "schema": "dc"}, {"key": "dc.rights.url", "value": "https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/", "language": null, "element": "rights", "qualifier": "url", "schema": "dc"}]
id jyx.123456789_19899
language fin
last_indexed 2025-03-31T20:03:13Z
main_date 2007-01-01T00:00:00Z
main_date_str 2007
online_boolean 1
online_urls_str_mv {"url":"https:\/\/jyx.jyu.fi\/bitstreams\/fa84d10e-bf8a-446e-8189-56c675ffd7b9\/download","text":"CL Pullinen.pdf","source":"jyx","mediaType":"application\/pdf"}
publishDate 2007
record_format qdc
source_str_mv jyx
spellingShingle Pullinen, Katri Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky kestävyyssuorituskyky luurankolihas geeniekspressio perinnöllisyys Liikuntafysiologia
title Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
title_full Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
title_fullStr Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
title_full_unstemmed Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
title_short Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
title_sort luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
title_txtP Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
topic kestävyyssuorituskyky luurankolihas geeniekspressio perinnöllisyys Liikuntafysiologia
topic_facet Liikuntafysiologia geeniekspressio kestävyyssuorituskyky luurankolihas perinnöllisyys
url https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/19899 http://www.urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-20094141436
work_keys_str_mv AT pullinenkatri luurankolihaksengeeniekspressiojaperinnöllinenkestävyyssuorituskyky